Nel dettaglio

Genoma freddo sequenziato


Di tutti i comuni problemi di salute, forse nessuno è familiare come il freddo. L'infiammazione delle vie aeree superiori è di origine virale, ma poiché esistono molti tipi di rinovirus, è comune che ogni volta che uno nuovo causi infezione.
Non esiste un vaccino contro il freddo e il trattamento si riduce a trattare i sintomi - come naso che cola e tosse, dolori muscolari, testa e gola e malessere - che non sono causati da virus ma dalla reazione del corpo all'invasione. L'infezione da rinovirus è responsabile della metà degli attacchi di asma ed è un fattore importante nei casi di bronchite, sinusite, otiti e polmonite.

Un grande passo verso una crescente consapevolezza dell'importante problema è stato appena compiuto dai ricercatori negli Stati Uniti.

In un articolo pubblicato sul sito web della rivista Science, il gruppo descrive di aver completato le sequenze genomiche di tutti i 99 ceppi noti di virus che causano il raffreddore comune.

Le sequenze sono state organizzate in una specie di albero genealogico che mostra come i virus sono collegati tra loro, le loro somiglianze e differenze. Gli autori sottolineano che il lavoro fornisce uno strumento potente che potrebbe portare allo sviluppo dei primi efficaci trattamenti a freddo.
"Fino ad oggi non siamo riusciti a sviluppare farmaci efficaci per curare il raffreddore comune, il che potrebbe essere dovuto alla mancanza di informazioni sulla composizione genetica di tutti i ceppi", ha affermato Stephen Liggett, professore della School of Medicine e direttore del programma. di genomica cardiopolmonare presso l'Università del Maryland, autore principale dello studio.

"Di solito pensiamo ai raffreddori come a un semplice inconveniente, ma possono essere debilitanti nei bambini piccoli o negli anziani. Possono anche portare ad attacchi di asma a qualsiasi età. Inoltre, studi recenti indicano che le infezioni da rinovirus nei bambini piccoli possono programmare i loro sistemi immunitari per sviluppare l'asma nell'adolescenza ", ha affermato Liggett.
Gli scienziati hanno scoperto che i rinovirus umani sono organizzati in 15 piccoli gruppi ereditati da antenati lontani. La scoperta di questi gruppi multipli spiega perché l'approccio dell '"unico rimedio freddo" non funziona.
Hanno anche osservato che i virus saltano un passo nella produzione di proteine, una scorciatoia che probabilmente aumenta la velocità del microrganismo per far sentire i sintomi subito dopo l'infezione.

"Questa è una nuova intuizione che non sarebbe stata possibile senza essere rivelata attraverso l'analisi genomica.

Le informazioni risultanti da questa scoperta possono rappresentare un approccio completamente diverso alla terapia ", ha affermato Claire Fraser-Liggett, direttrice dell'Istituto di scienze genomiche dell'Università del Maryland, un altro autore dello studio.

Lo studio ha sottolineato che alcuni dei rinovirus umani derivano dallo scambio di materiale genetico tra due distinti ceppi virali che infettano lo stesso individuo. Tale ricombinazione non era ritenuta possibile nei rinovirus umani. Durante i mesi più freddi, quando molti ceppi di virus causano infezioni, la ricombinazione può rapidamente produrre nuovi ceppi.
Mutazioni multiple (circa 800) erano evidenti nei campioni di virus ottenuti dai ricercatori da pazienti con raffreddore rispetto ai vecchi ceppi di riferimento del rinovirus. Alcuni virus si modificano attraverso lievi cambiamenti in alcune proteine ​​per impedire loro di essere distrutti dagli anticorpi nel sistema immunitario umano. "Le mutazioni sono state trovate in ogni area del genoma", ha detto Claire.
“I dati accumulati da queste sequenze genomiche complete ci danno l'opportunità di riconsiderare i vaccini contro il raffreddore come una possibilità, soprattutto quando raccogliamo campioni da molti pazienti e sequenziamo interi genomi per vedere con quale frequenza subiscono le mutazioni durante i mesi più freddi. "Ha detto Stephen Liggett. Questa continuazione dello studio ora pubblicato è già in corso.
L'articolo Il sequenziamento e l'analisi di tutti i genomi del rinovirus umano noti rivelano che struttura ed evoluzione, di Stephen Liggett e altri, possono essere lette dagli abbonati Science a (//www.sciencemag.org)

Adattato da: Agência Fapesp - Diffusione scientifica - 13/02/09

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